创新平台
当前位置：beat365·(中国)正版唯一官方网站-app Store>创新平台>
基因测序及基因组学技术平台
基因测序及基因组学技术平台
2020/7/30 9:58:30 beat365·(中国)正版唯一官方网站-app Store
基因测序及基因组学平台，是2012年依托中国农业科技华南创新中心搭建的Illumina公司MiSeq测序仪和NextSeq500测序仪的测序平台。可以针对不同的需求实现更专门的应用，提供多种测序读长、通量和时间周期选择，满足各类科研及应用需求对成本和速度的差异化需求。应用于复杂疾病、农业基因组学、微生物学和宏基因组学等研究领域; 可与传统临床医学、动物医学的最新科研结果结合，形成精准医疗，为疾（疫）病诊断、治疗、临床决策、毒株变异监测等带来革命性、颠覆性、去“卡脖子”性的改变及发展。
一、服务内容：
主要为科研、高校、企业研发机构等提供完整的基因检测研究方案，集咨询、样品制备、建库、测序、数据质量检测、深度的生物信息分析为一体。根据用户要求进行个性化实验设计及数据分析，解决数据分析难题和提供论文撰写咨询。
主要服务内容：新基因组测序-组装， 基因组重测序-SNP分析，简化基因组测序-QTL定位，转录组测序-组装-差异表达基因分析等。
精准服务项目包括:
一、服务内容：
主要为科研、高校、企业研发机构等提供完整的基因检测研究方案，集咨询、样品制备、建库、测序、数据质量检测、深度的生物信息分析为一体。根据用户要求进行个性化实验设计及数据分析，解决数据分析难题和提供论文撰写咨询。
主要服务内容：新基因组测序-组装， 基因组重测序-SNP分析，简化基因组测序-QTL定位，转录组测序-组装-差异表达基因分析等。
精准服务项目包括:
l 动植物基因组测序
全基因组de novo测序
l 外显子组测序
SNP遗传图谱构建
全基因组关联分析
BSA性状定位分析
群体进化分析
l 动植物转录组测序
全长转录组
宏转录组测序
比较转录组测序
lncRNA测序
circRNA测序
small RNA测序
l 动植物表观组测序
全基因组甲基化测序
ChIP-seq
RIP-seq
l 微生物基因组测序
细菌基因组de novo测序
真菌基因组de novo测序
16S/18S/ITS等扩增子测序
宏基因组测序
二、服务流程
从材料选取，建库测序，到数据分析，确保科学和缜密，以保障高质量研究成果。
三、应用案例
（一）科研服务：被广泛应用于复杂疾病、农业基因组学、微生物学和宏基因组学等研究领域。
（二）产业服务：
1.养殖：易感基因筛查、早期诊断、精准监测、精准免疫；
2.疫苗：疫苗毒株筛选分析；临床变异监测；靶标挖掘；数据库建设；
3.微生物：优势菌筛选，精准调控；保种，靶标挖掘；
4.其他：基因数据分析及基因数据库定制。
联系方式
联系人：朱老师
联系电话: 020-85161412，13826466467
电子邮箱：zhuqingfeng@agrogene.ac.cn
地址：广州市天河区金颖路20号创新大楼13楼
附：主要仪器简介
MiSeq测序仪是一台小型中低通量桌面式系统，具有测序速度快，数据准确的优点，具有革命性的便捷流程，比如：靶向基因测序、宏基因组测序、小型基因组测序、靶向基因表达、扩增子测序、16srRNA微生物多样性分析测序、转录组de novo测序、微生物基因组测序、小RNA测序、表达谱测序、ChIP-Seq等。
MiSeq能在单次运行中产生2x300 bp读长和高达15 Gb数据的台式测序仪，实现小型基因组的组装或目标变异的准确检测，特别是在同聚物区域，每次运行中产生比以往任何版本更多的reads。
NextSeq500测序仪延续Illumina经典的边合成边测序（SBS）原理，是世界上成功且被广泛采用的高通量测序技术，融合了数据通量和台式测序仪的简约，能够在单次运行中完成当下最热门的测序应用，具有流程简单、数据产量大（120Gb）和快速准确等特点。可在高产量（High Output）和中等产量（Medium Output）两种模式下开展测序实验，满足不同实验的需求，主要适用于全基因组、外显子组、转录组测序。
●操作更便捷。图标触控式操作系统，预制全部测序试剂，即拆即用；无需人工干预；操作步骤更少，质控更容易
●数据更准确。数据质量不受连续碱基重复区影响
●通量灵活。搭载高通量芯片和中通量芯片，可根据样本量自由选择，缩短样本收集时间，提高测序仪的使用效率。